Vid mikrobiell biokatalys används hela mikroorganismer (ofta jäst eller bakterier) för att omvandla en biomassa till en önskad produkt. Genom genmodifiering av cellen, sk. metabolic engineering, evolutionär anpassning, och/eller optimering av betingelserna för processen (temperatur, näring, syresättning etc.), kan man styra en mikroorganism till att producera just den produkt man vill ha från sin råvara på ett effektivt sätt. Det är en iterativ process, precis som när man arbetar med att skapa ett effektiv enzymatiskt system, innan man har hittat den perfekta mikroorganismen med de perfekta processbetingelserna. Målprodukten kan tas fram i syresatta (aerobiska) eller syrefria (anaerobiska) processer. Om man använder en syrefri process kallas detta också vanligen för fermentation.

Forskare inom mikrobiell katalys på Lunds universitet